华南农业大学转专业门槛低，有多个申请时间窗口。除学年制毕业班学生、学分制已修满规定总学分三分之二及以上学生以及已完成一次转专业学生等情况外，学生可以在每年春季学期初提出申请，转出无门槛，由转入学院进行选拔。华南农业大学每年都有超过500名同学成功转专业。 要注意的是，按照广东省招生办相关规定，华南农业大学中外合作办学和国际班学生入学后不能转到其他专业，但国际班之间可以互转或转入中外合作办学专业，中外合作办学专业可以互转但不能转到国际班。
提前批和普通批次学生除了不能转到艺术类专业外，可以申请转到其他任何专业，包括中外合作和国际班专业。艺术类考生不能转到非艺术类专业。